V roku 1963 vydala RAF požiadavku na nový cvičný stroj, ktorý by v roku 1974 nahradil typy Folland Gnat a Hawker Hunter. Záujem o spoločný vývoj mala z politických dôvodov predovšetkým Veľká Británia. A tak bola nakoniec 17.května 1965 uzavretá dohoda o spoločnom vývoji a výrobe cvičného a bojového letúna. Predbežne bolo objednaných 300 lietadiel: 150 cvičných pre RAF, a 75 cvičných a 75 bojových pre Armée de l'Air. V roku 1970 už po vzlete prototypu Británia svoje požiadavky prehodnotila a rozhodla sa zmeniť špecifikáciu letúna na hĺbkový taktický bombardér. Objednala 165 jednomiestnych a len 35 dvojmiestnych Jaguar. Úlohu cvičných strojov mali zastávať Hawker P.1182 (neskôr známe ako Hawk).
Za francúzsku stranu sa projektu zúčastnil Breguet Aviation a za britskú British Aircraft Corporation. Ako zastrešujúci orgán vznikla v máji 1966 spoločnosť SEPECAT (Société Europénne de Production de l'Avion d'Ecole de Combat et d'Appui Tactique, Európska spoločnosť pre výrobu letúna pre školské účely a taktickú bojovú podporu). V júni 1967 sa Breguet Aviation zlúčil so spoločnosťou Dassault.
Jaguar bol prvým anglo-fracouzským bojovým lietadlom a prvým lietadlom RAF, ktoré malo celú výrobnú dokumentáciu v metrických jednotkách. Meno Jaguar dostal letún v roku 1965 na parížskej leteckej prehliadke a motor bol pomenovaný Adour.
Prvý prototyp francúzsky cvičný dvojmiestny (E-01) vykonal roll-out 17.dubna 1968. Prvý let bol naplánovaný na 15.června, ale kvôli organizačným zdržiavaniu sa uskutočnil až 8. septembra 1968. V februári 1969 nasledoval prototyp E-02 a 23.marca 1969 vzlietol prvý jednomiestny Jaguar A-03. Hneď pri prvom lete prekonal rýchlosť zvuku. Ďalšie A-04 vzlietol 27.května 1969. Jediný palubný prototyp M-05 vzlietol 14.listopadu 1969.
Prvý britský jednomiestny Jaguár S-06 vzlietol 12. októbra 1969. Bol osadený britskú avionikou a výzbrojou a mal zabudované zariadenie na tankovanie za letu. Nasledoval S-07 12.června 1970. Ôsmy prototyp dvojmiestny B-08 označovaný ako predsériové stroj vzlietol 30. augusta 1971.
Ťažkosti v spolupráci zapríčinené chýbajúcim hlavným kontraktor, a zmeny v definícii určenia letúne zapríčinili oddialenie operačného nasadenia. Prvý sériový letún zišiel z výrobnej linky závodu v Toulouse v júni 1971, dodávky letectvu začali v máji 1972 a prvá jednotka dosiahla operačné spôsobilosti v júni 1973. Francúzske Jaguár (označené Jaguar A) boli spoločne s Dassault Mirage III E chrbticou francúzskych jadrových síl.
Prvý sériový britský Jaguár zišiel z výrobnej linky závodu vo Wartonu v polovici roka 1973. K jednotkám RAF bol Jaguár (verzia Gr.1) zaraďovaný od júna 1973 a nahrádzal typ MDD F-4 Phantom II v úlohe stíhacieho bombardéru. Prvá jednotka dosiahla operačné spôsobilosti v marci 1974. Väčšina britských jaguárov bola rozmiestnená v Nemecku ako súčasť taktického bombardovacieho letectva NATO. V deväťdesiatych rokoch boli Jaguár nahradené letúny Panavia Tornado a Jaguár zostali iba v Británii na základni v Coltishallu.
Súčasné určenia letúna je ničenie pozemných cieľov v rámci taktickej podpory pozemných jednotiek, ďalej potom pokračovacie a operačný výcvik. Britské letúny sa používajú aj pre prieskum.
Lietadlo má vysoký podvozok s dvojitými kolesami. To z neho robí lietadlo výnimočne vhodné pre poľné letisko, odkiaľ môže operovať aj s ťažkým nákladom podvesených zbraní. Po celej dĺžke odtokovej hrany sú dvojštrbinový vztlakové klapky, ktoré podstatne skracujú nároky letúna na dĺžku VPD. Počas letových ztkoušek bolo okrem iného nad odtokovou hranu krídla podľa pravidla plôch pridané púzdro, ktoré obsahuje hlavné výmenník tepla. Lietadlo je vyzbrojený dvoma 30 mm kanónmi. Britské cvičné T.2 a exportné stroje majú iba jeden 30 mm kanón. Na jeden podtrupový (nosnosť 1134 kg) a štyri podkřídlové závesníky (vnútorná 1134 kg, vonkajší 567 kg) je možné zavesiť variabilný výzbroj do celkovej hmotnosti 4 536 kg.
Jednomiestne letúny môžu byť vybavené nadstavcami pre tankovanie paliva za letu.
Obe národné verzie sa od seba značne líšia vybavením. Každá krajina používa komponenty svojich výrobcov a každá krajina mala na lietadlo úplne rozdielne požiadavky.
Výzbroj britských jaguárov tvoria kontajnerové bomby BL755, klasické pumy o hmotnosti 455 kg, neriadené rakety ráže 68 mm, kontajnery s prieskumným alebo rušivým vybavením a až tri prídavné nádrže s objemom po 1200 litrov. Pre účely navigácie a presného bombardovania je letún vybavený systémom NAVWASS - navigation and weapon-aiming sub-systems. Jeho súčasťou je laserový diaľkomer a značkovač cieľov a priehľadový (head-up) displej, ktorý dovoľuje pilotovi rokov v prízemnej výške za všetkých poveternostných podmienok bez toho aby musel odvracať pohľad na palubné prístroje. Britské lietadlá majú naviac v hornej časti SOP zabudovaný varovný RL prijímač. Časť britských lietadiel bola dodatočne vybavená ďalším párom závesníkov na hornej ploche krídla pre dvojicu protilietadlových riadených striel AIM-9 Sidewinder.
V súčasnosti prechádzajú britskej jaguármi omladzovacou kúrou, ktorej súčasťou je aj inštalácia zariadenia pre nočné videnie a tomu zodpovedajúce osvetlenie kabíny a zabudovanie FLIR (Forward Looking Infra-Red).
Francúzske jaguármi nemali pôvodne žiadne laserové zariadenia a použitá sedačka neumožňuje katapultáž pri rýchlostiach menších než 167 km / hod. Teraz sú nasadzované s laserom navádzanú protizemní RS AS-30L a streleckým kontajnerom pre vyhľadávanie cieľov a navádzanie výzbroje ATLIS. Francúzske lietadlá sú okrem bežných vybavené aj kontajnerovými bombami BULOUGA a môžu niesť taktickú jadrovú pumu AN 52. Ďalšie možné kombinácie výzbroje sú: jedna protiradarová riadená strela AS.37 Martel a dve prídavné nádrže alebo 8 kusov 454 kg bômb, a alebo kombinácie PLŘS, púm, nádrží, raketnic a prieskumných kontajnerov.
Jaguármi ešte stále vyrába v licencii India (firma HAL - Hindustan Aeronautica Ltd.). Prvých 46 lietadiel bolo zmontuje z dielov dodaných Veľkou Britániou. Ďalšie v Indii postavenej Jaguár majú o niečo vyspelejšie avioniku. Sú vybavené systémom DARINA. Ten zahŕňa kombinovanú mapu a elektronický displej Ferranti, inerciálny navigačný systém, head-up displej. Zostáva zachovaný laserový zameriavač označených cieľov. V indickom letectvu (IAF) má prezývku Shamsher - lev.
Ekvivalentom Jaguaru je sovietsky MiG-27.
